El primer culto luterano se efectuó en el mes de mayo de 1865 por el pastor A . Tyszka, párroco destinado a Puerto Montt, a bordo de un buque anclado en la bahía ; posteriormente, en forma esporádica, siguió atendiendo a los protestantes de origen alemán en la Union Church de la calle San Agustín (la calle donde hoy en día se encuentran los Tribunales de Justicia).La Comunidad, propiamente tal, se constituyó el 7 de marzo de 1867.

El 27 de octubre de 1867 llegó a Valparaíso quien sería el primer pastor de nuestra comunidad, el señor Oskar Fiedler, quien siguió atendiendo en forma regular en la Union Church. Así, estuvo todo, hasta el 15 de abril de 1879, fecha en la que se disolvió la comunidad debido a los problemas económicos que originó la guerra con el Perú. Pasaron los años y a fines de 1889 se organizó un directorio provisorio de la comunidad, el cual llamó al pastor Benjamin Kögel. En estos difíciles momentos de reorganización, nuestra comunidad recibió la gran ayuda de la Union Church, quien le facilitó su nuevo templo de la calle condell para que se pudieran celebrar allí los cultos y de la Iglesia Anglicana quien ofreció el Instituto Anglicano del Cerro Concepción para que se pudieran realizar allí otras actividades comunitarias.

Nuestra comunidad se organizó internamente con la redacción de los estatutos en castellano, 15 de septiembre de 1890, los que fueron aprobados por el gobierno de Chile, el 6 de diciembre 1892 ; con ello, la comunidad obtuvo los derechos legales propios de una corporación. El pastor Kögel regresó a Alemania en 1893 ; después de él , el pastor Th.Schmidt -hasta entonces pastor en Valdivia- se hizo cargo de la comunidad.